홍기헌 가옥도 주변 가옥과 같이 직선축을 이용하여 서쪽을 향하도록 배치되어있는데, 양반집인데도 소슬대문이 아닌 초가대문이라는 특이함이 있다.
제일 깊숙한 곳에 一자형의 안채가 자리를 잡았고, 이와 평행하여 사랑채가 안마당을 사이에 두고 一자형으로 자리하였다. 사랑마당 앞에는 대문채가 역시 서향으로 자리를 잡아 안채로부터 대문채까지가 거의 일직선의 축선 상에 놓이듯이 배열되어 있다. 사랑채는 1732년, 안채는 1910년에 지어졌다고 한다.
문간채는 남쪽부터 대문간·광 2칸·헛간·잿간으로 이루어져 있는데, 이것은 조선시대가 아닌 근래에 지어졌다. 가옥의 뒤곁에는 굴뚝과 장독대가 있는데, 장독대에는 옹기그릇이 정갈하게 놓여 있다.